Hanya ada tiga hal yang bisa Anda lakukan selama berada di gugusan Kepulauan Raja Ampat, apakah itu di Mansuar, Kurkapa, Batbintem atau di atas Pinisi sekalipun yakni diving, snorkeling atau berjemur di pantai yang berpasir putih. Berikut adalah beberapa lokasi terbaik yang wajib untuk diselami atau bersnorkeling:
Sardines Reef
Sardines merupakan reef tanpa pulau yang menyembul di permukaan
Lokasi: Terletak antara Koh Island dan Mioskon
Apa yang ditemui: selain keindahan terumbu karang, juga terdapat Schooling fish (gerombolan ikan yang berenang dalam jumlah sangat besar, hingga beribu-ribu jumlahnya), seperti ikan jack fish, trevally, fusiliers (endemik di Raja Ampat baik yang sirip kuning maupun biru), beberapa penyu, dan hiu karpet (wobegong) yang tengah tidur di atas pasir serta ikan sedot (ikan yang biasa menempel di ikan hiu). Ikan sedot ini tak lagi malu untuk mengikuti kemanapun penyelam bergerak.
Pulau Wei
Lokasi: Terletak diantara Pulau Batanta dan Mansuar
Apa yang ditemui: Di pulau kecil yang memanjang dari barat ke timur ini memiliki pasir putih dan pantainya yang landai. Juga terdapat sumur mata air tawar. Bagus untuk berjemur. Untuk menyelam di kedalaman 27 m sampai 30 m dapat menemukan bangkai mesin-mesin pembunuh sisa perang dunia II berupa pesawat terbang dan kapal. Satu diantaranya US Army Force P-47D Thunderbolt Razorback.
Kri Island
Disebut-sebut sebagai pusat kerajaan dunia bawah air Raja Ampat.
Lokasi: 30 menit dari Pulau Waisai
Apa yang ditemui: kondisi topografi steep slope dengan terumbu karang yang cantik. Setrta gerombolan ikan kuwe, kakap, kerapu, hiu karang, napoeleon wrasse, barracuda, tuna and giant trevally.
Boleh dibilang jumlah ikan dan varietasnya sangat mengagumkan. Dr. Gerald R Allen, seorang marine biologist dan pengarang sejumlah referensi buku buku kelautan pernah meneliti di pulau Kri. Ia mencatat ada 283 jenis ikan dalam sekali penyelaman.
Friambonda
Lokasi: Berada di bagian utara Pulau Kri
Apa yang ditemui: Keanekaragaman dan keindahan coral dan aneka ikan, khususnya nudi branch putih (kelinci laut) dan beberapa ulat laut yang indah. Beberapa spot anemone yang kaya dengan anemone fish n shrimp. Serta Gugusan coral masih bisa ditemui hingga kedalaman 30m.
Fam Island
Lokasi: Berada di bagian barat Pulau Batanta
Apa yang ditemui: Spot-spot penyelaman dengan area terumbu karang, sponges dan soft coral dengan semburat warna menyolok. Menawarkan dinding karang yang indah serta keberadaan nudibranch. Airnya relatif tenang dan jernih kehijauan.
Terdapat Lagoon yang terbentuk secara alamiah di sela-sela pulau ini dengan air laut yang dangkal dan tenang berwarna cyan ditambah dengan ukiran-ukiran alam pada bebatuan karang.
Manta Point
Lokasi: Desa Arborek di antara Pulau Gam dan Pulau Mansuar..
Apa yang ditemui: Manta ray atau ikan pari manta atau hantu laut atau kelelawar raksasa dasar laut. Inilah primadonanya. ukuran tubuhnya bisa mecapai sekitar 6-7 meter dan berbobot hingga 2 ton. Bila tak bisa menyelam, jangan khawatir, Manta ray masih bisa disaksikan dengan bersnorkeling atau cukup berdiri di dermaga saja.
Transportasi: 2 jam dengan kapal cepat (Rp 100.000), 4 jam dengan kapal perintis milik Pemda (Rp 125.000) atau 5 jam dengan longboat (Rp. 300.000) dari Waisai.
Sauwandarek
Lokasi:Â Kawasan Selat Dampier, Distrik Meos Mansar,
Apa yang ditemui: Berbagai jenis ikan seperti kuda laut mini (pigmy seahorse), udang mantis, blue ring octopus, ikan mandarin, kakap (schooling snapper) dan menikmati berada dekat dengan gerombolan ikan tuna dan barakuda.
Daratan bisa melakukan trekking menuju Telaga Yenauwyau dengan airnya yang asin.Transportasi: 4 jam dengan kapal dengan longboat (Rp. 300.000) dari Waisai atau 3 jam dengan speedboat (sewa Rp 5 juta/hari) dari Sorong.
The Passage
Lokasi: Tak seberapa jauh dari Waigeo.
Apa yang ditemui: Archerfish di tengah hutan bakau, berbagai jenis batu karang, kuda laut dan percula clownfish.
Teluk Mayalibit
Lokasi: Pulau Waigeo
Apa yang ditemui: Tempat pemijahan bagi ikan lema, bobara dan tenggiri, kaya akan plankton dan ebi (udang kecil) dan tempat hidup lumba-lumba putih serta berbagai macam jenis kerang, udang dan kepiting.
Teluk Kabui
Lokasi: Pulau Waigeo Selatan 30 menit dari Waisai.
Apa yang ditemui: Pulau-pulau karang terjal yang menjulang tinggi (karst), goa tengkorak dan situs sejarah Raja Ampat di Kali Raja. Snorkeling merupakan pilihan tepat untuk menikmati terumbu karang dangkal.
MisoolÂ
Lokasi: Misool
Apa yang ditemui: Dipenuhi dengan kehidupan ikan-ikan dan binatang laut lainnya. Sejumlah gua juga dapat ditemui di daerah itu. Sekelompok ikan dan kuda laut yang hidup di kedalaman kurang dari 10 meter pun dapat dilihat jelas.
Pulau Wayag
Lokasi: Distrik Waigeo Barat
Apa yang ditemui: Pulau ini terdiri dari gugusan pulau-pulau karst terjal berbentuk seperti cendawan yang bermunculan dari dalam laut. Untuk menikmati keindahan yang menakjubkan tersebut terlebih dahulu
mendaki puncak pulau karang selama 30 menit jalan kaki. Untuk bisa mencapai puncaknya harus memanjat tebing setinggi 3 meter dengan kemiringan 90 derajat. Segala jerih payah ini akan terbayar lunas, keindahan Pulau Wayag yang tersembunyi akan terhampar dengan segala kemegahannya.,
Selesai mendaki, pengunjung dapat melakukan penyelaman. Penyu, manta ray, dan ikan kalabia adalah beberapa satwa yang bisa dinikmati. Primadonanya Kalabia yakni ikan hiu berbentuk kadal ini berjalan dengan siripnya ketika mencari makan di atas karang-karang.ikan jenis baru dari genus Hemiscylliidae selain di Raja Ampat juga ditemui di perairan laut Teluk Cenderawasih dan Teluk Triton.
Transportasi: 6-8 jam menggunakan longboat (sewa Rp. 6 juta/hari) dari Waisai atau 5 jam menggunakan speedboat (sewa Rp. 9 juta/hari) langsung dari Sorong.
WARNING: Wisatawan tanpa sertifikat menyelam, jangan harap bisa menyelam di Raja Ampat. Syarat wajib ini dikeluarkan oleh Dinas Pariwisata Raja Ampat bagi para pelancong yang datang.
Menginap Dimana
Kri Resort, Pulau Mansuar*
Sorindo Bay Resort, Pulau Mansuar*
(* harga silahkan cek di www.papua-diving.com)
Misol Eco Resort, Pulau Batbintem
(* harga silahkan cek di www.diverajaampat.com)
Papua Paradise Eco Resort, Birie, Pulau Batanta
(* harga silahkan cek di www.seahorseparadise.com)
Raja Ampat Dive Resort, Pulau Waiwo
(* harga silahkan cek di www.rajaampatdiveresoret.com)
DIVE OPERATOR
Grand Komodo and Dive Paradise Indonesia  www.komodoalordive.com
PinditoLiveaboard                                          www.pindito.com
PT Seven Seas CahayaUtama             www.thesevenseas.net
The Archipelago Fleet                   www.archipelago-fleet.com
Misool Eco Resort                      www.misoolecoresort.com
Ondina                              www.smyondina.com
Kararu Dive Voyages                    www.kararu.com
Papua Diving                                                 www.papua-diving.com
Dive Damai                                                   www.dive-damai.com
Silolona Sojourns                      www.silolona.com
PT South Seas Indonesia                             www.thearenui.com
PT Dewi Nusantara                     www.dewi-nusantara.com
Ocean Rover Cruises                    www.ocean-rover.com
PT Tribal Diving / Shakti Raja Ampat        www.shakti-raja-ampat.com
Tambora Dive Cruises                   www.tamboradive.com
PT Tiger Blue                          www.tigerblue.info
Anjemiwa Dive Safaris                   www.anjemiwadivesafaris.com